PERBEDAAN UTAMA ORGANISASI GENOM MANUSIA, TUMBUHAN, INSEKTA, RAGI DAN BAKTERI (A1-AG1)

•September 25, 2008 • Leave a Comment


Nama : Yuli Ratna N

NIM : B1J006123

E-mail : mungil_82892000@yahoo.com

Website : ulliefabio06.wordpress.com

Jenis Topik : A1-AG1

Genom manusia bukanlah satu-satunya urutan genom terlengkap. Organisme lainnya yang memiliki urutan genom yang cukup kompleks yaitu, tumbuhan, ragi, bakteri, dan insekta. Ukuran genom dengan kompleksitas organisme tidak selalu memperlihatkan korelasi. Tidak selamanya organisme yang sederhana memiliki ukuran genom yang kecil. Ketika urutan genom manusia telah dipublikasikan, urutan genom organisme lain pun sudah diketahui dan dipelajari. Ada beberapa perbedaan utama genom antar organisme. Secara umum, perbedaan genom manusia, tumbuhan, insekta, ragi, dan bakteri terletak pada komposisi urutan genom seperti: gen, intron, pseudogen, dan genom-wide repeat (genom yang sama tetapi terdapat pada beberapa tempat).

Manusia memiliki 3 milyar pasang basa. Beberapa pasang basa tersebut bersatu dalam sebuah satu kesatuan yang dinamakan genom. Genom manusia merupakan model, terdiri dari genom inti dan genom mitokondria. Dalam genom manusia terdapat 1 gen yan g dinamakan TRY4 yang mengandung informasi untuk mensintesis protein yang disebut trypsinogen. TRY4 merupakan gen yang diskontinyu. Adapun bagian lainnya adalah 2 segmen gen, 1 pseudogen, 52 genome-wide repeat, 2 mikrosatelit

Dengan kata lain, genom manusia terdiri dari urutan yang non-gen, non repetitif, untai tunggal DNA. Genom manusia merupakan genom yang kompleks tetapi itu bukan jaminan kalau ukuran organisme ditentukan oleh kekomplekan genom. Pada urutan genom manusia terdapat banyak pengulangan genom (genome-wide repeat)

Organisasi lainnya adalah tumbuhan, kloroplas adalah salah satu organel tumbuhan yang mampu berfotosintesis. DNA tidak hanya terdapat pada nukleus tetapi juga terdapat pada kloroplas atau mitokondria. Genom pada kloroplas terdiri dari 2 gen, pada setiap kloroplas terdapat RNA ribosom (16 S; 23 S; 4,5 S; 5 S). Struktur dari genom kloroplas hampir sama dengan mitokondria, DNA kloroplas memiliki ukuran dengan kisaran antara 80 kb- 600 kb, sebagai contoh: genom padi yaitu 134.525 bp. Pada genom tumbuhan terdapat 1 gen yaitu Adhl-f, dan sebagian besar merupakan genome-wide repeat. Salah satu genom tumbuhan yang telah dipublikasikan adalah Oryza sativa.

Insekta adalah organisme eukariotik yang memiliki kandungan genom yang cukup kompleks. Genom insekta terutama lalat buah (Drosophilla melanogaster yakni: terdapat intron, gen, genome-wide repeat. Pada lalat buah hanya sedikit pengulangan genom atau disebut juga genome-wide repeat. Genom lalat buah lebih banyak mengandung intron

Yeast atau yang lebih kita kenal dengan ragi merupakan eukariotik seperti tumbuhan dan manusia, hanya saja yeast merupakan eukariotik yang sederhana. Yeast merupakan organisme eukariotik yang sederhana tetapi memiliki komposisi gen yang besar yaitu 5800 gen. Urutan genom yeast lebih banyak mengndung gen diskontinyu, dan genome-wide repeat yang sedikit

Selain organisme eukariotik, adapun organisme prokariotik. Prokariotik memiliki genom yang sederhana, sehingga banyak orang yang telah mempublikasikan jauh sebelum organisme eukariotik. Saat ini telah ada 20 organisme prokariotik yang telah selesai di baca urutan genom dan telah dipublikasikan secara terbuka. Ukuran genom bakteri tidak lebih dari 0,6 Mega basa pair – 10 Mega basa pair. Sebagai contoh adalah: Clostridium acetobuylicum adalah bakteri yang dapat mengubah zat pati menjadi pelarut organik aseton dan butanol yang sangat bermanfaat untuk industri. Pembacaan genom bakteri ini selesai pada tahun 1999. Pada genom prokariotik terdapat operon yang merupakan kelompok gen yang saling bersebelahan dalam suatu genom, dengan 2 nukleotida pada satu gen. Semua gen pada suatu operon merupakan unti tunggal yang bertanggung jawab dalam pengaturan pada organisme prokariotik

Pustaka Terkait:

Brown, T.A (2002) DNA in Genomes, 2nd ed., http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=genomes.section.5234 diakses tanggal 22 September 2008

Semester baru nie….

•September 11, 2008 • 1 Comment

Temen2 2006….

g kerasa y udah semester 5 lagi, kynya baru kmren nie qta OSPEK METAMORFOSIS euy…hehehe.eh qta punya adik juga lho…serasa udah tua y…

gimana nie udah pada prepare dunkz buat tugas2 qta didepan nnie yg udh nungguin qta,praktikum kah?tugas seabrek kah?ujian tengah semester kah?ujian akhir kah?PKL kah?bahkan lebih jauhnya lagi TUGAS AKHIR nie…temen2 semuanya tetep pada semangat y,,,qta semua disini sama2 belajar n inget tetep ikhlas dengan apa yang qta hadapi bareng2 disini…qta sama2 berjuang kan?

o ya ni berlaku juga bwt smua orng yg ngunjungi blog yuli,,,,hehehe

cekap sakieu heula akh ke di lajengkeun deui tos tunduh hoyong geura kulem,hehehe

Pseudomonas aeruginosa memperlihatkan dorongan pergerakan tanpa adanya pili dan flagella tipe IV

•May 9, 2008 • Leave a Comment

Pseudomonas aeruginosa memperlihatkan dorongan motilitas yang bergerombol dalam media agar yang merupakan sumber dari karbon dan nitrogen. PAO1 mengekspresikan mutan dobel dengan tidak disertai oleh pili dan flagella tipe IV yang biasa digunakan bakteri untuk motilitas. Tanpa adanya pili dan flagella tipe IV juga P. aeruginosa dapat melakukan pergerakan pada kondisi yang sama. Flagella sangat diperlukan koloni untuk berinteraksi. Dorongan pergerakan sangat bergantung pada kondisi lingkungan.

  

 

Dorongan mtilitas akan dihambat oleh ekspresi pilus tipe IV, akan tetapi pergerakan ini akan meningkat apabila disisipkan transposon pada gacA dan gacS dan pengembalian formasi tendril pada penyebaran koloni. P. aeruginosa bergerak juga dipengaruhi oleh faktor kohesi yang sama dalam pembatasan translokasi. Faktor dispersif pun memfasilitasi terjadinya penyebaran.

Pembelajaran dorongan motilitas pada P. aeruginosa sangat penting untuk mengidentifikasi faktor selain pili dan flagella yang dapat mempengaruhi tingkah laku dari koloni P. aeruginosa.

NAMA  : YULI RATNA NAWANGSARI

NIM     : B1J006123

EMAIL: http://mungil_82892000@yahoo.com/

WEBSITE : http://ulliefabio06.wordpress.com/

PUSTAKA:

 

 

 

 

 

 

 

 

Hello world!

•March 25, 2008 • 3 Comments

Welcome to WordPress.com. This is your first post. Edit or delete it and start blogging!